Protein–RNA interactions for Protein: Q96NB2

SFXN2, Sideroflexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFXN2Q96NB2 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFXN2Q96NB2 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFXN2Q96NB2 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFXN2Q96NB2 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFXN2Q96NB2 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFXN2Q96NB2 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFXN2Q96NB2 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFXN2Q96NB2 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFXN2Q96NB2 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFXN2Q96NB2 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SFXN2Q96NB2 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFXN2Q96NB2 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFXN2Q96NB2 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFXN2Q96NB2 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFXN2Q96NB2 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFXN2Q96NB2 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFXN2Q96NB2 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFXN2Q96NB2 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFXN2Q96NB2 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFXN2Q96NB2 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFXN2Q96NB2 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFXN2Q96NB2 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFXN2Q96NB2 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFXN2Q96NB2 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFXN2Q96NB2 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFXN2Q96NB2 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFXN2Q96NB2 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFXN2Q96NB2 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SFXN2Q96NB2 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFXN2Q96NB2 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFXN2Q96NB2 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFXN2Q96NB2 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFXN2Q96NB2 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFXN2Q96NB2 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFXN2Q96NB2 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFXN2Q96NB2 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFXN2Q96NB2 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFXN2Q96NB2 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SFXN2Q96NB2 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SFXN2Q96NB2 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SFXN2Q96NB2 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFXN2Q96NB2 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SFXN2Q96NB2 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFXN2Q96NB2 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFXN2Q96NB2 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFXN2Q96NB2 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFXN2Q96NB2 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFXN2Q96NB2 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFXN2Q96NB2 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFXN2Q96NB2 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFXN2Q96NB2 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFXN2Q96NB2 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFXN2Q96NB2 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFXN2Q96NB2 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFXN2Q96NB2 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFXN2Q96NB2 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFXN2Q96NB2 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFXN2Q96NB2 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFXN2Q96NB2 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFXN2Q96NB2 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFXN2Q96NB2 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFXN2Q96NB2 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFXN2Q96NB2 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFXN2Q96NB2 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFXN2Q96NB2 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFXN2Q96NB2 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFXN2Q96NB2 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFXN2Q96NB2 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFXN2Q96NB2 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFXN2Q96NB2 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFXN2Q96NB2 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFXN2Q96NB2 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SFXN2Q96NB2 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SFXN2Q96NB2 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFXN2Q96NB2 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SFXN2Q96NB2 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFXN2Q96NB2 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFXN2Q96NB2 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFXN2Q96NB2 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFXN2Q96NB2 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFXN2Q96NB2 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFXN2Q96NB2 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFXN2Q96NB2 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFXN2Q96NB2 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFXN2Q96NB2 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFXN2Q96NB2 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFXN2Q96NB2 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFXN2Q96NB2 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFXN2Q96NB2 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFXN2Q96NB2 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFXN2Q96NB2 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFXN2Q96NB2 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFXN2Q96NB2 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFXN2Q96NB2 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFXN2Q96NB2 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFXN2Q96NB2 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFXN2Q96NB2 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFXN2Q96NB2 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFXN2Q96NB2 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFXN2Q96NB2 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms