Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms