Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

Predictions only

Length 2,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms