Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms