Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms