Protein–RNA interactions for Protein: Q14CN2

CLCA4, Calcium-activated chloride channel regulator 4, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA4Q14CN2 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLCA4Q14CN2 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLCA4Q14CN2 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLCA4Q14CN2 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLCA4Q14CN2 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLCA4Q14CN2 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLCA4Q14CN2 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLCA4Q14CN2 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLCA4Q14CN2 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLCA4Q14CN2 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLCA4Q14CN2 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLCA4Q14CN2 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLCA4Q14CN2 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLCA4Q14CN2 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLCA4Q14CN2 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLCA4Q14CN2 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLCA4Q14CN2 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLCA4Q14CN2 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLCA4Q14CN2 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLCA4Q14CN2 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLCA4Q14CN2 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLCA4Q14CN2 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLCA4Q14CN2 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLCA4Q14CN2 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLCA4Q14CN2 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLCA4Q14CN2 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLCA4Q14CN2 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLCA4Q14CN2 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLCA4Q14CN2 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLCA4Q14CN2 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLCA4Q14CN2 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLCA4Q14CN2 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLCA4Q14CN2 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CLCA4Q14CN2 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLCA4Q14CN2 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLCA4Q14CN2 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLCA4Q14CN2 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLCA4Q14CN2 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLCA4Q14CN2 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLCA4Q14CN2 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLCA4Q14CN2 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLCA4Q14CN2 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLCA4Q14CN2 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLCA4Q14CN2 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLCA4Q14CN2 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLCA4Q14CN2 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLCA4Q14CN2 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLCA4Q14CN2 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLCA4Q14CN2 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLCA4Q14CN2 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLCA4Q14CN2 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CLCA4Q14CN2 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CLCA4Q14CN2 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CLCA4Q14CN2 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CLCA4Q14CN2 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CLCA4Q14CN2 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CLCA4Q14CN2 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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CLCA4Q14CN2 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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CLCA4Q14CN2 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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