Protein–RNA interactions for Protein: Q13972

RASGRF1, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRF1Q13972 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RASGRF1Q13972 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RASGRF1Q13972 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RASGRF1Q13972 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms