Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
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