Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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SKP2Q13309 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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SKP2Q13309 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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SKP2Q13309 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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SKP2Q13309 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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SKP2Q13309 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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SKP2Q13309 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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SKP2Q13309 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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SKP2Q13309 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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