Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 ATP6V1G1-201ENST00000374050 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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