Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms