Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms