Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms