Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTSSP25774 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTSSP25774 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTSSP25774 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTSSP25774 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTSSP25774 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTSSP25774 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTSSP25774 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTSSP25774 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTSSP25774 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTSSP25774 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTSSP25774 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTSSP25774 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTSSP25774 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTSSP25774 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTSSP25774 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTSSP25774 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTSSP25774 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTSSP25774 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTSSP25774 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTSSP25774 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTSSP25774 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTSSP25774 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTSSP25774 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTSSP25774 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTSSP25774 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTSSP25774 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTSSP25774 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTSSP25774 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTSSP25774 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTSSP25774 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTSSP25774 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTSSP25774 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTSSP25774 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTSSP25774 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTSSP25774 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTSSP25774 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTSSP25774 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTSSP25774 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTSSP25774 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTSSP25774 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTSSP25774 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTSSP25774 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTSSP25774 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTSSP25774 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTSSP25774 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTSSP25774 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTSSP25774 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTSSP25774 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTSSP25774 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTSSP25774 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CTSSP25774 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTSSP25774 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTSSP25774 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTSSP25774 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTSSP25774 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTSSP25774 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTSSP25774 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTSSP25774 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CTSSP25774 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTSSP25774 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTSSP25774 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTSSP25774 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTSSP25774 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CTSSP25774 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTSSP25774 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTSSP25774 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTSSP25774 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTSSP25774 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTSSP25774 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTSSP25774 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTSSP25774 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTSSP25774 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTSSP25774 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTSSP25774 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTSSP25774 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTSSP25774 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTSSP25774 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTSSP25774 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTSSP25774 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTSSP25774 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTSSP25774 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTSSP25774 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTSSP25774 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTSSP25774 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTSSP25774 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTSSP25774 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTSSP25774 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTSSP25774 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTSSP25774 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTSSP25774 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTSSP25774 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTSSP25774 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTSSP25774 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTSSP25774 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTSSP25774 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTSSP25774 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTSSP25774 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTSSP25774 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTSSP25774 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms