Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR2CP19387 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR2CP19387 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR2CP19387 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
POLR2CP19387 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
POLR2CP19387 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
POLR2CP19387 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
POLR2CP19387 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
POLR2CP19387 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
POLR2CP19387 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
POLR2CP19387 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2CP19387 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2CP19387 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2CP19387 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2CP19387 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2CP19387 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2CP19387 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2CP19387 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2CP19387 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2CP19387 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2CP19387 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2CP19387 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2CP19387 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2CP19387 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2CP19387 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2CP19387 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2CP19387 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2CP19387 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2CP19387 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2CP19387 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2CP19387 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2CP19387 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2CP19387 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2CP19387 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2CP19387 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2CP19387 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2CP19387 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2CP19387 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2CP19387 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2CP19387 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2CP19387 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2CP19387 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2CP19387 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2CP19387 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2CP19387 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2CP19387 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2CP19387 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2CP19387 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2CP19387 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2CP19387 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2CP19387 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2CP19387 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2CP19387 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2CP19387 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2CP19387 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2CP19387 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2CP19387 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2CP19387 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2CP19387 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2CP19387 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2CP19387 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2CP19387 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2CP19387 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2CP19387 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2CP19387 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2CP19387 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2CP19387 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2CP19387 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2CP19387 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2CP19387 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2CP19387 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2CP19387 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2CP19387 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2CP19387 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2CP19387 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2CP19387 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2CP19387 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2CP19387 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2CP19387 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2CP19387 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2CP19387 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2CP19387 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2CP19387 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2CP19387 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2CP19387 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2CP19387 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2CP19387 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2CP19387 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2CP19387 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2CP19387 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2CP19387 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2CP19387 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2CP19387 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2CP19387 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2CP19387 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2CP19387 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2CP19387 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2CP19387 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2CP19387 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2CP19387 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms