Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms