Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms