Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU6

FAM8A1, Protein FAM8A1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM8A1Q9UBU6 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM8A1Q9UBU6 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms