Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT2

CACNG6, Voltage-dependent calcium channel gamma-6 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG6Q9BXT2 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNG6Q9BXT2 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNG6Q9BXT2 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNG6Q9BXT2 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNG6Q9BXT2 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNG6Q9BXT2 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNG6Q9BXT2 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNG6Q9BXT2 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNG6Q9BXT2 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNG6Q9BXT2 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNG6Q9BXT2 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms