Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms