Protein–RNA interactions for Protein: Q99742

NPAS1, Neuronal PAS domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS1Q99742 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPAS1Q99742 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NPAS1Q99742 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NPAS1Q99742 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPAS1Q99742 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPAS1Q99742 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPAS1Q99742 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPAS1Q99742 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPAS1Q99742 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPAS1Q99742 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPAS1Q99742 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPAS1Q99742 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPAS1Q99742 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPAS1Q99742 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPAS1Q99742 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPAS1Q99742 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPAS1Q99742 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPAS1Q99742 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPAS1Q99742 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPAS1Q99742 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPAS1Q99742 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPAS1Q99742 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPAS1Q99742 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPAS1Q99742 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPAS1Q99742 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NPAS1Q99742 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NPAS1Q99742 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPAS1Q99742 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPAS1Q99742 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPAS1Q99742 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPAS1Q99742 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPAS1Q99742 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPAS1Q99742 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPAS1Q99742 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPAS1Q99742 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPAS1Q99742 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPAS1Q99742 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPAS1Q99742 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NPAS1Q99742 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NPAS1Q99742 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPAS1Q99742 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPAS1Q99742 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPAS1Q99742 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPAS1Q99742 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NPAS1Q99742 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPAS1Q99742 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPAS1Q99742 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPAS1Q99742 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPAS1Q99742 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPAS1Q99742 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPAS1Q99742 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPAS1Q99742 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPAS1Q99742 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPAS1Q99742 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPAS1Q99742 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPAS1Q99742 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPAS1Q99742 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NPAS1Q99742 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPAS1Q99742 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPAS1Q99742 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPAS1Q99742 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPAS1Q99742 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NPAS1Q99742 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPAS1Q99742 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPAS1Q99742 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPAS1Q99742 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPAS1Q99742 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPAS1Q99742 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPAS1Q99742 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPAS1Q99742 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPAS1Q99742 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPAS1Q99742 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPAS1Q99742 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPAS1Q99742 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPAS1Q99742 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPAS1Q99742 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NPAS1Q99742 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPAS1Q99742 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPAS1Q99742 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPAS1Q99742 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPAS1Q99742 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NPAS1Q99742 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPAS1Q99742 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NPAS1Q99742 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPAS1Q99742 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPAS1Q99742 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPAS1Q99742 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPAS1Q99742 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPAS1Q99742 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPAS1Q99742 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPAS1Q99742 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPAS1Q99742 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPAS1Q99742 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPAS1Q99742 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPAS1Q99742 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPAS1Q99742 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPAS1Q99742 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPAS1Q99742 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPAS1Q99742 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPAS1Q99742 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms