Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms