Protein–RNA interactions for Protein: Q96GC9

VMP1, Vacuole membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VMP1Q96GC9 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VMP1Q96GC9 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VMP1Q96GC9 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VMP1Q96GC9 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VMP1Q96GC9 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VMP1Q96GC9 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VMP1Q96GC9 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VMP1Q96GC9 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VMP1Q96GC9 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VMP1Q96GC9 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VMP1Q96GC9 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VMP1Q96GC9 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VMP1Q96GC9 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VMP1Q96GC9 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VMP1Q96GC9 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VMP1Q96GC9 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VMP1Q96GC9 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VMP1Q96GC9 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VMP1Q96GC9 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VMP1Q96GC9 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VMP1Q96GC9 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VMP1Q96GC9 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VMP1Q96GC9 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VMP1Q96GC9 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VMP1Q96GC9 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VMP1Q96GC9 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
VMP1Q96GC9 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VMP1Q96GC9 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VMP1Q96GC9 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VMP1Q96GC9 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VMP1Q96GC9 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
VMP1Q96GC9 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VMP1Q96GC9 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VMP1Q96GC9 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VMP1Q96GC9 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VMP1Q96GC9 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VMP1Q96GC9 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VMP1Q96GC9 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VMP1Q96GC9 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VMP1Q96GC9 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VMP1Q96GC9 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VMP1Q96GC9 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VMP1Q96GC9 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VMP1Q96GC9 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VMP1Q96GC9 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VMP1Q96GC9 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VMP1Q96GC9 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VMP1Q96GC9 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VMP1Q96GC9 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VMP1Q96GC9 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VMP1Q96GC9 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VMP1Q96GC9 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VMP1Q96GC9 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VMP1Q96GC9 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VMP1Q96GC9 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VMP1Q96GC9 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VMP1Q96GC9 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VMP1Q96GC9 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VMP1Q96GC9 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VMP1Q96GC9 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VMP1Q96GC9 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VMP1Q96GC9 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VMP1Q96GC9 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
VMP1Q96GC9 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VMP1Q96GC9 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VMP1Q96GC9 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VMP1Q96GC9 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VMP1Q96GC9 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VMP1Q96GC9 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VMP1Q96GC9 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VMP1Q96GC9 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VMP1Q96GC9 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VMP1Q96GC9 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VMP1Q96GC9 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VMP1Q96GC9 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VMP1Q96GC9 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VMP1Q96GC9 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VMP1Q96GC9 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VMP1Q96GC9 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
VMP1Q96GC9 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VMP1Q96GC9 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VMP1Q96GC9 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VMP1Q96GC9 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VMP1Q96GC9 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VMP1Q96GC9 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VMP1Q96GC9 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VMP1Q96GC9 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VMP1Q96GC9 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VMP1Q96GC9 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VMP1Q96GC9 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VMP1Q96GC9 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VMP1Q96GC9 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
VMP1Q96GC9 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
VMP1Q96GC9 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
VMP1Q96GC9 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
VMP1Q96GC9 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
VMP1Q96GC9 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
VMP1Q96GC9 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
VMP1Q96GC9 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VMP1Q96GC9 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms