Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HLA-CQ95604 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HLA-CQ95604 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HLA-CQ95604 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HLA-CQ95604 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HLA-CQ95604 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HLA-CQ95604 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HLA-CQ95604 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HLA-CQ95604 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HLA-CQ95604 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HLA-CQ95604 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HLA-CQ95604 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HLA-CQ95604 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HLA-CQ95604 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HLA-CQ95604 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HLA-CQ95604 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HLA-CQ95604 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HLA-CQ95604 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HLA-CQ95604 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HLA-CQ95604 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HLA-CQ95604 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HLA-CQ95604 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HLA-CQ95604 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HLA-CQ95604 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HLA-CQ95604 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HLA-CQ95604 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HLA-CQ95604 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HLA-CQ95604 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HLA-CQ95604 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HLA-CQ95604 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HLA-CQ95604 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HLA-CQ95604 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HLA-CQ95604 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HLA-CQ95604 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HLA-CQ95604 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HLA-CQ95604 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HLA-CQ95604 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HLA-CQ95604 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HLA-CQ95604 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HLA-CQ95604 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HLA-CQ95604 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HLA-CQ95604 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HLA-CQ95604 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HLA-CQ95604 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HLA-CQ95604 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HLA-CQ95604 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HLA-CQ95604 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HLA-CQ95604 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HLA-CQ95604 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HLA-CQ95604 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HLA-CQ95604 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HLA-CQ95604 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HLA-CQ95604 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HLA-CQ95604 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HLA-CQ95604 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HLA-CQ95604 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HLA-CQ95604 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HLA-CQ95604 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HLA-CQ95604 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HLA-CQ95604 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HLA-CQ95604 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HLA-CQ95604 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HLA-CQ95604 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HLA-CQ95604 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HLA-CQ95604 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HLA-CQ95604 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HLA-CQ95604 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HLA-CQ95604 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HLA-CQ95604 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HLA-CQ95604 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HLA-CQ95604 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HLA-CQ95604 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HLA-CQ95604 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HLA-CQ95604 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HLA-CQ95604 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HLA-CQ95604 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HLA-CQ95604 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HLA-CQ95604 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HLA-CQ95604 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HLA-CQ95604 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HLA-CQ95604 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HLA-CQ95604 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HLA-CQ95604 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HLA-CQ95604 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HLA-CQ95604 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HLA-CQ95604 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HLA-CQ95604 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HLA-CQ95604 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HLA-CQ95604 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HLA-CQ95604 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HLA-CQ95604 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HLA-CQ95604 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HLA-CQ95604 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HLA-CQ95604 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HLA-CQ95604 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HLA-CQ95604 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms