Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms