Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms