Protein–RNA interactions for Protein: Q53EU6

GPAT3, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAT3Q53EU6 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms