Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC12.92□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms