Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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