Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SHROOM2Q13796 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SHROOM2Q13796 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SHROOM2Q13796 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SHROOM2Q13796 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SHROOM2Q13796 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SHROOM2Q13796 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SHROOM2Q13796 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SHROOM2Q13796 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SHROOM2Q13796 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SHROOM2Q13796 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SHROOM2Q13796 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SHROOM2Q13796 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SHROOM2Q13796 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SHROOM2Q13796 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SHROOM2Q13796 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SHROOM2Q13796 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SHROOM2Q13796 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SHROOM2Q13796 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SHROOM2Q13796 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SHROOM2Q13796 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SHROOM2Q13796 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SHROOM2Q13796 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SHROOM2Q13796 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SHROOM2Q13796 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SHROOM2Q13796 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SHROOM2Q13796 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SHROOM2Q13796 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SHROOM2Q13796 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SHROOM2Q13796 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SHROOM2Q13796 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
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SHROOM2Q13796 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
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