Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms