Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms