Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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