Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
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