Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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PTPN13Q12923 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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PTPN13Q12923 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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PTPN13Q12923 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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