Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms