Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ARID4AP29374 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ARID4AP29374 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ARID4AP29374 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ARID4AP29374 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ARID4AP29374 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ARID4AP29374 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ARID4AP29374 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ARID4AP29374 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ARID4AP29374 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ARID4AP29374 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ARID4AP29374 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ARID4AP29374 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARID4AP29374 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARID4AP29374 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARID4AP29374 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARID4AP29374 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARID4AP29374 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARID4AP29374 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARID4AP29374 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARID4AP29374 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARID4AP29374 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARID4AP29374 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARID4AP29374 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARID4AP29374 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARID4AP29374 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARID4AP29374 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ARID4AP29374 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARID4AP29374 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARID4AP29374 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ARID4AP29374 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ARID4AP29374 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARID4AP29374 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARID4AP29374 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARID4AP29374 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARID4AP29374 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARID4AP29374 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARID4AP29374 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ARID4AP29374 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARID4AP29374 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARID4AP29374 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARID4AP29374 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARID4AP29374 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARID4AP29374 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARID4AP29374 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARID4AP29374 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARID4AP29374 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARID4AP29374 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARID4AP29374 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ARID4AP29374 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ARID4AP29374 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ARID4AP29374 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ARID4AP29374 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ARID4AP29374 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ARID4AP29374 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ARID4AP29374 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ARID4AP29374 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ARID4AP29374 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms