Protein–RNA interactions for Protein: P11369

Pol, LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP11369 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PolP11369 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PolP11369 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PolP11369 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PolP11369 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PolP11369 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PolP11369 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PolP11369 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PolP11369 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PolP11369 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PolP11369 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PolP11369 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PolP11369 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PolP11369 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PolP11369 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PolP11369 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PolP11369 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PolP11369 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PolP11369 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PolP11369 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PolP11369 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PolP11369 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PolP11369 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PolP11369 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PolP11369 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PolP11369 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PolP11369 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PolP11369 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PolP11369 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PolP11369 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PolP11369 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PolP11369 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PolP11369 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PolP11369 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PolP11369 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PolP11369 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PolP11369 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PolP11369 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PolP11369 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PolP11369 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PolP11369 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PolP11369 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PolP11369 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PolP11369 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PolP11369 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PolP11369 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PolP11369 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PolP11369 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PolP11369 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PolP11369 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PolP11369 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PolP11369 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PolP11369 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PolP11369 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PolP11369 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PolP11369 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PolP11369 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PolP11369 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PolP11369 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PolP11369 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PolP11369 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PolP11369 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PolP11369 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PolP11369 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PolP11369 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PolP11369 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PolP11369 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PolP11369 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PolP11369 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PolP11369 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PolP11369 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PolP11369 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PolP11369 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PolP11369 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PolP11369 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PolP11369 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PolP11369 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PolP11369 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PolP11369 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PolP11369 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PolP11369 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PolP11369 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PolP11369 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PolP11369 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PolP11369 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PolP11369 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PolP11369 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PolP11369 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PolP11369 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PolP11369 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PolP11369 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PolP11369 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PolP11369 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PolP11369 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PolP11369 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PolP11369 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PolP11369 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PolP11369 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PolP11369 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PolP11369 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms