Protein–RNA interactions for Protein: P10911

MCF2, Proto-oncogene DBL, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2P10911 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MCF2P10911 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
MCF2P10911 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MCF2P10911 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MCF2P10911 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MCF2P10911 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MCF2P10911 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
MCF2P10911 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MCF2P10911 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MCF2P10911 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
MCF2P10911 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
MCF2P10911 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
MCF2P10911 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MCF2P10911 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MCF2P10911 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MCF2P10911 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MCF2P10911 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MCF2P10911 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MCF2P10911 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MCF2P10911 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MCF2P10911 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MCF2P10911 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MCF2P10911 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MCF2P10911 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MCF2P10911 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MCF2P10911 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MCF2P10911 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MCF2P10911 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MCF2P10911 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MCF2P10911 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MCF2P10911 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MCF2P10911 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MCF2P10911 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MCF2P10911 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MCF2P10911 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MCF2P10911 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MCF2P10911 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MCF2P10911 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
MCF2P10911 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MCF2P10911 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MCF2P10911 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MCF2P10911 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MCF2P10911 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
MCF2P10911 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
MCF2P10911 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MCF2P10911 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MCF2P10911 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MCF2P10911 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
MCF2P10911 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MCF2P10911 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MCF2P10911 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
MCF2P10911 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MCF2P10911 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MCF2P10911 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MCF2P10911 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
MCF2P10911 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MCF2P10911 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MCF2P10911 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
MCF2P10911 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MCF2P10911 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MCF2P10911 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
MCF2P10911 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MCF2P10911 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
MCF2P10911 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
MCF2P10911 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MCF2P10911 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
MCF2P10911 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
MCF2P10911 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MCF2P10911 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MCF2P10911 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MCF2P10911 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MCF2P10911 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
MCF2P10911 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MCF2P10911 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MCF2P10911 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MCF2P10911 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MCF2P10911 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MCF2P10911 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MCF2P10911 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MCF2P10911 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MCF2P10911 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MCF2P10911 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MCF2P10911 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
MCF2P10911 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MCF2P10911 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MCF2P10911 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MCF2P10911 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MCF2P10911 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
MCF2P10911 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MCF2P10911 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MCF2P10911 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MCF2P10911 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MCF2P10911 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MCF2P10911 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MCF2P10911 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MCF2P10911 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MCF2P10911 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MCF2P10911 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MCF2P10911 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MCF2P10911 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms