Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms