Protein–RNA interactions for Protein: P05546

SERPIND1, Heparin cofactor 2, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPIND1P05546 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SERPIND1P05546 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SERPIND1P05546 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SERPIND1P05546 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SERPIND1P05546 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SERPIND1P05546 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SERPIND1P05546 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SERPIND1P05546 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SERPIND1P05546 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SERPIND1P05546 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SERPIND1P05546 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SERPIND1P05546 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SERPIND1P05546 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SERPIND1P05546 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SERPIND1P05546 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SERPIND1P05546 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SERPIND1P05546 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SERPIND1P05546 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SERPIND1P05546 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SERPIND1P05546 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SERPIND1P05546 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SERPIND1P05546 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SERPIND1P05546 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SERPIND1P05546 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SERPIND1P05546 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SERPIND1P05546 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SERPIND1P05546 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SERPIND1P05546 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SERPIND1P05546 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SERPIND1P05546 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SERPIND1P05546 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SERPIND1P05546 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SERPIND1P05546 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SERPIND1P05546 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SERPIND1P05546 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SERPIND1P05546 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SERPIND1P05546 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SERPIND1P05546 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SERPIND1P05546 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SERPIND1P05546 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SERPIND1P05546 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SERPIND1P05546 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SERPIND1P05546 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SERPIND1P05546 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SERPIND1P05546 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SERPIND1P05546 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SERPIND1P05546 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SERPIND1P05546 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SERPIND1P05546 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SERPIND1P05546 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SERPIND1P05546 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SERPIND1P05546 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SERPIND1P05546 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SERPIND1P05546 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SERPIND1P05546 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SERPIND1P05546 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SERPIND1P05546 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SERPIND1P05546 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SERPIND1P05546 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SERPIND1P05546 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SERPIND1P05546 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SERPIND1P05546 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SERPIND1P05546 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SERPIND1P05546 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SERPIND1P05546 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SERPIND1P05546 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SERPIND1P05546 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SERPIND1P05546 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SERPIND1P05546 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SERPIND1P05546 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SERPIND1P05546 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SERPIND1P05546 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SERPIND1P05546 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SERPIND1P05546 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SERPIND1P05546 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SERPIND1P05546 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SERPIND1P05546 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SERPIND1P05546 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SERPIND1P05546 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SERPIND1P05546 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SERPIND1P05546 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SERPIND1P05546 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SERPIND1P05546 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SERPIND1P05546 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SERPIND1P05546 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SERPIND1P05546 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SERPIND1P05546 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SERPIND1P05546 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SERPIND1P05546 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SERPIND1P05546 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SERPIND1P05546 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SERPIND1P05546 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SERPIND1P05546 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SERPIND1P05546 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SERPIND1P05546 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SERPIND1P05546 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SERPIND1P05546 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SERPIND1P05546 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SERPIND1P05546 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SERPIND1P05546 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms