Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SPAG9O60271 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
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