Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXA3O43365 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXA3O43365 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXA3O43365 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXA3O43365 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXA3O43365 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXA3O43365 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXA3O43365 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXA3O43365 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXA3O43365 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXA3O43365 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXA3O43365 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXA3O43365 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXA3O43365 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXA3O43365 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXA3O43365 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXA3O43365 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXA3O43365 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXA3O43365 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXA3O43365 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXA3O43365 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXA3O43365 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXA3O43365 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXA3O43365 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXA3O43365 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXA3O43365 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXA3O43365 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXA3O43365 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXA3O43365 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXA3O43365 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXA3O43365 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXA3O43365 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXA3O43365 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXA3O43365 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXA3O43365 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXA3O43365 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXA3O43365 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXA3O43365 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXA3O43365 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXA3O43365 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXA3O43365 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXA3O43365 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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HOXA3O43365 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
HOXA3O43365 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
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HOXA3O43365 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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HOXA3O43365 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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HOXA3O43365 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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HOXA3O43365 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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HOXA3O43365 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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HOXA3O43365 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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