Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
B4DXG7 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
B4DXG7 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DXG7 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DXG7 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DXG7 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DXG7 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DXG7 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DXG7 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DXG7 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DXG7 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DXG7 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DXG7 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DXG7 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DXG7 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DXG7 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DXG7 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DXG7 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DXG7 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DXG7 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DXG7 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DXG7 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DXG7 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DXG7 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DXG7 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DXG7 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DXG7 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DXG7 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DXG7 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DXG7 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DXG7 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DXG7 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DXG7 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DXG7 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DXG7 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DXG7 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DXG7 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DXG7 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DXG7 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DXG7 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DXG7 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DXG7 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DXG7 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DXG7 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DXG7 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DXG7 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DXG7 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DXG7 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
B4DXG7 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
B4DXG7 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
B4DXG7 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
B4DXG7 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
B4DXG7 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
B4DXG7 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
B4DXG7 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
B4DXG7 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
B4DXG7 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
B4DXG7 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
B4DXG7 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
B4DXG7 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
B4DXG7 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
B4DXG7 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
B4DXG7 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
B4DXG7 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
B4DXG7 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
B4DXG7 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
B4DXG7 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
B4DXG7 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
B4DXG7 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
B4DXG7 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
B4DXG7 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
B4DXG7 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
B4DXG7 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
B4DXG7 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
B4DXG7 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
B4DXG7 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
B4DXG7 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
B4DXG7 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
B4DXG7 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
B4DXG7 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DXG7 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DXG7 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DXG7 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DXG7 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DXG7 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DXG7 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DXG7 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DXG7 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DXG7 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DXG7 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DXG7 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DXG7 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DXG7 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DXG7 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DXG7 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DXG7 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DXG7 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DXG7 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DXG7 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DXG7 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms