Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms