Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
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