Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms