Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms