Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

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Length 562 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
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