Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms